Térben látható génműködés

Harminchét egyetemi hallgató és doktorandusz részvételével került sor 2026. szeptember 1. és 4. között a térség fejlődésbiológusait tömörítő Visegrád Group Society for Developmental Biology (V4SDB) szervezésében a V4SDB Nyári Egyetemre, melynek az ELTE TTK Biológiai Intézete adott otthont. Az esemény célja az volt, hogy a fejlődésbiológusok új nemzedékét megismertesse a térbeli transzkriptomikával, azzal az alig pár éve feltűnt, de gyorsan fejlődő módszercsaláddal, amely nemcsak azt mutatja meg, mely gének aktívak egy szövetben, hanem azt is, hogy pontosan hol.

A nyári egyetemet Varga Máté (ELTE Genetikai Tanszék) szervezte, és Lázár Enikő (KTH Royal Institute of Technology, Stockholm) „Spatial Biology: Towards Decoding Tissue Architecture” című nyilvános előadása nyitotta meg. A következő napokban a hallgatók egymás után ismerhették meg a ma használt legfontosabb térbeli transzkriptomikai platformokat a különböző gyakorlati modulokon: Raphaël Mauron és Sergio Marco Salas (KTH) Visium- és Xenium-alapú méréseket mutatott be, Konstantin Khodosevich (BRIC, Koppenhágai Egyetem) előadását követően pedig Katarina Dragicevic és Ralbovszki Dorottya (BRIC) tartott egy Xenium-foglalkozást. A többrétegű (multiomikai) térbeli elemzést lehetővé tevő DBiT-Seq technikát Shuozhen Bao (SciLifeLab / KTH) mutatta be. Végül a programot egy MERFISH-modul zárta, amelyet Jonathan Enriquez (Institut de Génomique Fonctionnelle de Lyon) és Yinan Wan (Biozentrum, Bázeli Egyetem) előadása alapozott meg. A hét folyamán az esemény ipari szponzorai, a Bruker és a Genetica is bemutatták legújabb térbeli transzkriptomikai platformjaikat.

A sűrű szakmai program mellett a résztvevőknek lehetőségük volt ismerkedésre, kötetlen beszélgetésekre is, ami a tapasztalatok szerint segíti a jövőbeli munkakapcsolatok, vagy akár barátságok kialakulását.

A 2026-os V4SDB Hallgatói Nyári Egyetem résztvevőinek és oktatóinak csoportképe

 „A térbeli transzkriptomikai módszerek egy minőségi metodológiai ugrást jelentenek a fejlődésbiológiában, hiszen ötvözik a klasszikus immunhisztokémiai módszerek és a modern egysejt-szekvenálási eljárások előnyeit. Ma már ugyanazon a szövetmintán pontról pontra, sejtről sejtre követhetjük a génexpressziót, a kromatinállapotot és a fehérjeszintet is” — mondta Varga Máté, a nyári egyetem szervezője.

A nyári egyetem megvalósulását a The Company of Biologists nagylelkű támogatása tette lehetővé, amely számos vendéghallgató és előadó utazási és tartózkodási költségeit fedezte, valamint az ELTE saját Egyetemi Kiválósági Alapja (EKA), amely a nemzetközi oktatók meghívását és a kurzus gyakorlati hátterét támogatta. További támogatást nyújtott a Bruker, a Genetica és az IGATech cég. A Nyári Iskola elméleti és gyakolrati anyaga továbbra is szabadon elérhető az esemény honlapján.

A Nyári Iskola rövid időn belül a második hasonló esemény volt, hiszen 2025 januárjában a 2025-ös V4SDB Téli Iskolának adott otthont az ELTE TTK.